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| 地区 | 先天性心脏病诊断机构 | 先天性心脏病初步诊断机构 | 
| 福州 | 福建省儿童医院 | 福州市妇幼保健院 | 
| 福建中医药大学附属第二人民医院 | ||
| 福州福兴妇产医院(晋安区) | ||
| 连江县医院 | ||
| 罗源县医院 | ||
| 闽清县总医院 | ||
| 长乐区医院 | ||
| 长乐区妇幼保健院 | ||
| 莆田 | 莆田涵江医院 | 
 | 
| 三明 | 三明市中西医结合医院 | 
 | 
| 泰宁县总医院 | ||
| 大田县总医院 | ||
| 清流县医院 | ||
| 尤溪县总医院 | ||
| 沙县总医院 | ||
| 将乐县总医院 | ||
| 泉州 | 泉州市第一医院城东分院 | 
 | 
| 福建医科大学附属第二医院东海院区 | ||
| 泉港区医院 | ||
| 泉州市中医院 | ||
| 漳州 | 漳州正兴医院 | 东山县医院 | 
| 漳州市人民医院 | ||
| 漳州市中医院 | ||
| 漳州市第三医院 | ||
| 长泰区医院 | ||
| 南靖县医院 | ||
| 平和县医院 | ||
| 南平 | 浦城县医院 | 南平市建阳第一医院、松溪县医院、政和县医院 | 
| 武夷山市立医院 | ||
| 龙岩 | 龙岩市第二医院 | 武平县医院 | 
| 永定区医院 | ||
| 宁德 | 福鼎市医院 | 周宁县医院 | 
| 柘荣县医院 | ||
| 蕉城区医院(宁德人民医院) | ||
| 平潭 | 
 | 平潭综合实验区医院 |